Natisni | A+ Aa BARVNA SHEMA
S strokovnostjo in prijaznostjo do zdravja.
MENI VSEBINA

Napredne genomske analize slovenskih otrok z motnjami avtističnega spektra

Naslov projektaNAPREDNE GENOMSKE ANALIZE SLOVENSKIH OTROK Z MOTNJAMI AVTISTIČNEGA SPEKTRA
ŠifraZ3-9294
VodjaAsist. dr. Danijela Krgović, univ. dipl. biokem.
Vodilna organizacijaUniverzitetni klinični center Maribor
Projektna skupinaSestava projektne skupine
TipPodoktorski raziskovalni projekt
Trajanje1.7.2018 - 30.06.2020
Financer

Javna agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije

Vsebinski opis

Motnje avtističnega spektra (MAS) so ena najbolj kompleksnih vedenjskih motenj, katerih prevalenca se v populaciji z leti konstantno zvišuje. Motnje so rezultat kompleksne interakcije genov in okolja, z močnim jasnim genetskim vplivom. V zadnjih nekaj letih je na področju genetike MAS dosežen viden napredek. V preteklosti so družinske študije in študije dvojčkov pokazale velik vpliv genetskih dejavnikov na razvoj te bolezni. Tehnični preboji na področju genetike pa so omogočili iskanje teh genetskih faktorjev. Tako danes vemo, da genetski dejavniki, njihov prispevek se ocenjuje na več kot 50%, ki prispevajo k MAS obsegajo različne mutacijske mehanizme, vključno z redkimi spremembami enega nukleotida (SNV), strukturnimi genomskimi variabilnostmi (SGV), kromosomskimi spremembami in pogostimi polimorfnimi različicami (SNP). Čeprav SNV pojasnijo nastanek motnje le v približno 1% primerov, so ravno te redke podedovane ali na novo nastale različice z visoko penetranco, ki motijo normalno izražanje enega samega gena, ključne za razumevanje etiologije MAS in razvoj metod zdravljenja.


Cilji naše raziskave slonijo na proučevanju prisotnosti redkih genetskih različic (SNV) pri slovenskih otrocih z  idiopatskim MAS z uporabo najnovejše tehnologije, sekvenciranje nove generacije (metoda NGS). Pri tem se bomo predvsem osredotočili določevanju vpliva analizirane različice na razvoj motnje pri posamezniku in postavitve genotip–fenotip povezave. Raziskava nam bo prav tako omogočila ocenoučinkovitosti (diagnostični izplen) uporabe metode NGS, kot diagnostične metode pri slovenski otrocih. S pomočjo te študije bomo lahko določili genetski vzrok za MAS pri znatno večjem številu pacientov, kar bo bistveno pripomoglo k boljši napovedi bolezni pri otroku, zmanjšanju sekundarnih kliničnih
znakov ter boljših možnosti zdravljenja. Boljša genetska obravnava otroka bo posledično pripomogla tudi k dobrobiti celotne družine, v smislu genetskega svetovanja za sorojence ali načrtovanje naslednje nosečnosti.

 

Načrt izvedbe projekta in časovna razporeditev

Izvedba dvoletnega projekta po posameznih fazah ter uresničevanje posameznih faz je predstavljeno v obliki preglednice.

Izvedba projektaPričakovani rezultatiRealizacija

1. leto
WP1. Klinična ocena bolnikovWP1. Klinična ocena bolnikov Razvrstitev preiskovancev v skupini s sindromskim ali ne-sindromskim MAS. Natančni klinični opisi preiskovancev – HPO klasifikacija za lažje postavljanje genotip-fenotip korelacij.80% ocena izvedena za 100/120 predvidenih preiskovancev
WP2. Sekvenciranje naslednje generacije (NGS)Določevanje SNV v eksonih genov z znanimi etiologijami v genetskih boleznih pri otrocih s sindromskim MAS.20% realizacija v teku
WP3. Potrjevanje določenih SNV in izključevanje dednostiIdentifikacija redkih SNV – seznam novih, redkih SNV; potrjevanje z alternativnimi molekularnimi metodami ter določevanje dednosti različice z genetsko analizo staršev preiskovancev.realizacija predvidena v drugi polovici projekta
2. leto
WP4. Analiza in vrednotenje določenih SNV s pomočjo bioinformatičnih orodijAnotacija redkih SNV: seznam SNV v kandidatnih genih za MAS; klinična klasifikacija določenih sprememb – ACMG smernice; postavljanje genotip-fenotip korelacij.realizacija predvidena v drugi polovici projekta
WP5.  Preučevanje signalnih potiNove povezave med kliničnimi in molekularnimi podatki: določitev možnih skupnih signalnih poti v katerih sodelujejo identificirani kandidatni geni.realizacija predvidena v drugi polovici projekta

Bibliografske referenceBibliografske reference
Telefonska centrala - informacije 02/321 1000 Nujna medicinska pomoč 112

Image
Image
© UKC Maribor 2015

Privzeto Arial Arial bold Verdana Verdana bold Open dyslexic Open dyslexic alta
Privzeto Barvna shema 1 - črno na belem Barvna shema 2 - belo na črnem Barvna shema 3 - črna na bež Barvna shema 4 - modro na belem Barvna shema 5 - črno na zelenem Barvna shema 6 - črno na rumenem Barvna shema 7 - modro na rumenem Barvna shema 8 - rumeno na modrem Barvna shema 9 - turkizno na črnem Barvna shema 10 - črno na vijoličnem
Privzeto Velikost pisave 14pt Velikost pisave 16pt Velikost pisave 18pt Velikost pisave 20pt
Velikost pisave 125% Velikost pisave 150% Velikost pisave 200%